בקונדטוריה והמאפיה של מצפה הימים מכינים את כל מגוון סוגי הבצק, הלחם, הגלידות והעוגות המוגשים במסעדה הצמחונית, תוך שימוש בביצים, מוצרי חלב וצמחי התבלין של משק המלון. המאפיה ממוקמת בסמוך לחנות המשק ובה ניתן לרכוש ממוצריה.
